163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4357 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  65.7 
 
 		 228 aa  274  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  65.22 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  70.98 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  68.04 
 
 		 237 aa  245  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  59.59 
 
 		 212 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  58.25 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  53.81 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  53.03 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  53.03 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  53.85 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  51.28 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  51.28 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  50.25 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  50.76 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  51.74 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  49.74 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  52.58 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  51.01 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  49.24 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  50.75 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  44.72 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  45.63 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  48.96 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  57.73 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  57.73 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  48.44 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  54.5 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  45.23 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  46.8 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  43.81 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  47.47 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  47.42 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  47.42 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  44.5 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  47.94 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  44.85 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  45.55 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  41.15 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  44.04 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  43.75 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  43.94 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  42.19 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  41.18 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  45.08 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  41.54 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  41.36 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  41.03 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  40.31 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  38.54 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  35.96 
 
 		 237 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  39.58 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  34.18 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  42.93 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  36.22 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  39.33 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  42.11 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  47.87 
 
 		 109 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  27.72 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  26.06 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  29.94 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  30.72 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  29.53 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  27.7 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  24.23 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  26.19 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  29.2 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  30.3 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  24.16 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  26.32 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  31.08 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  26.6 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  28.24 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  26.55 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  28.36 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  27.06 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  28.15 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  29.2 
 
 		 311 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  27.11 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.86 
 
 		 285 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.1 
 
 		 287 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  23.33 
 
 		 306 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  27.81 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  25.66 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  24.54 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  22.86 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  27.11 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  25.29 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0209  protein of unknown function DUF161  30.69 
 
 		 295 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.951556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>