173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0612 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  67.34 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  68.34 
 
 		 210 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  57.22 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  55.67 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  50.47 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  49.77 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  49.77 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  52.6 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  49.01 
 
 		 204 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  52.6 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  51 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  51.5 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  55.28 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  49 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  55.78 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  48.99 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  55.78 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  48.99 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  49 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  49.74 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  48.76 
 
 		 257 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  49.25 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  46.92 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  49.48 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  48.26 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  46.97 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  46.67 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  45.23 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  50.75 
 
 		 209 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  44.78 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  44.5 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  42.93 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  50.26 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  43.41 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  45.81 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  50 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  46.43 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  44.28 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  48.19 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  44.33 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  43.15 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  46.88 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  42.19 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  46.5 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  40.93 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  46.6 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  41.97 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  41.97 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  41.33 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  41.97 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  40.84 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  37.63 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.17 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  35.08 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  45.79 
 
 		 109 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  45.25 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  42.67 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  31.11 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  32.89 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  34.01 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  33.08 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  31.79 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  25.58 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  30.06 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  34.19 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  29.38 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  33.83 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  27.85 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  33.33 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  33.33 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  29.25 
 
 		 283 aa  62  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  25.81 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  28.79 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.03 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  29.7 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  27.01 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.08 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  29.53 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  29.68 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  28.86 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  31.93 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  30.56 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  26.58 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  28.57 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  28.17 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  31.14 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  30.11 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  28.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  26 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>