125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0050 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  45.67 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  41.71 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  40.2 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  39.05 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  39.05 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  41.15 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  40.62 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  41.92 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  39.9 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  37.8 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  40.95 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  39.58 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  38.34 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  44.79 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  40.38 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  38.19 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  40.82 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  36.46 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  36.46 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  47.67 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  36.15 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  43.01 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  39.06 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  43.01 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  39.06 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  39.06 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  36.46 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  37.82 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  41.97 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  35.08 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  34.45 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  38.46 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  40.1 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  33.98 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  35.05 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  37.11 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  37.11 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  35.89 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  37.82 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  34.58 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  35.94 
 
 		 202 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  37.11 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  36.67 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  36.6 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  37.37 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  37.24 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  35.94 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  34.72 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  32.99 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  33.68 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  47.92 
 
 		 109 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  35.39 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  32.9 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  31.32 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  26.71 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.04 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  33.75 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.04 
 
 		 285 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  31.48 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  22.17 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.24 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  27.21 
 
 		 295 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  27.1 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  30.65 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  29.84 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  34.09 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  26.29 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4742  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0590528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  26.44 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  24.43 
 
 		 298 aa  52  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.94 
 
 		 279 aa  51.6  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  28.21 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4464  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  28.73 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2546  hypothetical protein  35.22 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  28 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.41 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4531  hypothetical protein  26.15 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4884  hypothetical protein  26.15 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4751  hypothetical protein  26.15 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4367  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4378  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  28.87 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  29.25 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0493  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4768  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  26.16 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  27.06 
 
 		 286 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1873  protein of unknown function DUF161  26.99 
 
 		 288 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.83834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4769  hypothetical protein  25.13 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  26.92 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  22.67 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>