168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000952 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  94.55 
 
 		 202 aa  358  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  52.08 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  52.08 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  53.09 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  54.12 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  53.61 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  49.49 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  51.03 
 
 		 204 aa  204  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  50.25 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  51.55 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  51.55 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  52.06 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  51.31 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  49.75 
 
 		 211 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  50.25 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  46.07 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.07 
 
 		 257 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  46.15 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  45.55 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  47.96 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  49.74 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  47.42 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  44.1 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  46.63 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  47.42 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  43.46 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  46.91 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  45.03 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  43.23 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  45.36 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  42.71 
 
 		 228 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  44.5 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  39.59 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  41.24 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  40.21 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  41.97 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  44.04 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  42.93 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  41.88 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  39.69 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  41.54 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  41.24 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  38.07 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  46.11 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  46.63 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  46.11 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  44.56 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.5 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  33.85 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  36.79 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  39.02 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  35.94 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  33.17 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  37.31 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  52.58 
 
 		 109 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  34.74 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  27.67 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.38 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.98 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  27.97 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  30.97 
 
 		 314 aa  64.7  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  26.4 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  28.75 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  26.42 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  31.64 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  27.46 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  29.14 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  27.06 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  29.19 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.84 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  27.89 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  29.49 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  27.44 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  29.49 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  24.03 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  30.19 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  31.68 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.47 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  28.67 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  30.14 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  28.97 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  27.16 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  25.77 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.83 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  27.81 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  22.4 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  25.42 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  25.41 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  27.44 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  27.44 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  27.17 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  26.6 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  24.55 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  25.45 
 
 		 306 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  26.57 
 
 		 297 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  26.57 
 
 		 297 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>