156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0421 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  55.96 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  52.08 
 
 
212 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  49.25 
 
 
222 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  49.25 
 
 
222 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  48.45 
 
 
235 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  51.81 
 
 
211 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  49.74 
 
 
204 aa  191  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  51.74 
 
 
209 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  47.72 
 
 
204 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  47.21 
 
 
208 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  47.21 
 
 
208 aa  185  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  48.69 
 
 
204 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  46.23 
 
 
206 aa  184  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  45.23 
 
 
215 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  44.95 
 
 
210 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  44.44 
 
 
210 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  44.16 
 
 
204 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  44.55 
 
 
238 aa  178  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.77 
 
 
257 aa  177  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  44.9 
 
 
217 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  46.27 
 
 
217 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  50.52 
 
 
215 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  49.49 
 
 
237 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  48.98 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  44.33 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  44.33 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  45.13 
 
 
233 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  45.05 
 
 
200 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  45.05 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  42.78 
 
 
211 aa  157  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  41 
 
 
201 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  46.23 
 
 
211 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  40.59 
 
 
208 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  41.45 
 
 
214 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  43.08 
 
 
234 aa  147  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  43.56 
 
 
205 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  42.93 
 
 
202 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  45.08 
 
 
211 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  44.04 
 
 
200 aa  141  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  41.75 
 
 
202 aa  141  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  42.86 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  41.88 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  38 
 
 
203 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  44.27 
 
 
239 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  38.86 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  41.62 
 
 
237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  41.54 
 
 
198 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  36.08 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  34.38 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  38.19 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  39.38 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  35.75 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  33.85 
 
 
217 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  34.72 
 
 
215 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  47.42 
 
 
109 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  37.99 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  31.17 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  39.74 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.83 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  28.14 
 
 
294 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  30.37 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  31.21 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  28.39 
 
 
283 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  27.85 
 
 
322 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  30.97 
 
 
292 aa  61.6  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  25.61 
 
 
314 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.06 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  28.28 
 
 
283 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  24.86 
 
 
313 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  27.33 
 
 
311 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  27.6 
 
 
286 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  26.67 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  27.93 
 
 
290 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  28.42 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  33.91 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  30.37 
 
 
323 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  28.9 
 
 
309 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  33.91 
 
 
290 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  25.97 
 
 
278 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.79 
 
 
285 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  26.47 
 
 
315 aa  54.7  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  25.97 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  25.97 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  25.97 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  25.97 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  25.97 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  23.68 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  25.41 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  25.97 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  25.41 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.01 
 
 
285 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  28.65 
 
 
287 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  27.86 
 
 
292 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  30.08 
 
 
290 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  26.22 
 
 
297 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  26.22 
 
 
297 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  32 
 
 
278 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  25.97 
 
 
298 aa  52  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>