161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4349 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  44.79 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  45.6 
 
 		 222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  45.6 
 
 		 222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  44.27 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  58.64 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  46.39 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  42.71 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  42.27 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  43.98 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  42.42 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  39.58 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  40.91 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  42.13 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  40 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  43.46 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  43.46 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  41.33 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  43.46 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  42.13 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  41.88 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  37.95 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  41.15 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  41.24 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  41.15 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  41.62 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  41.84 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  40.72 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  40.4 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  40.91 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  43.94 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  39.06 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  41.29 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  42.19 
 
 		 237 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  38.54 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  40.62 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  40.1 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  38.02 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  37.5 
 
 		 228 aa  131  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  43.43 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  33.16 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  43.23 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  34.38 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  38.54 
 
 		 237 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  42.13 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  35.35 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  36.13 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  40.62 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  35.53 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  37.95 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  39.58 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  34.52 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  33.51 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  39.39 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  55.32 
 
 		 109 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  35.39 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  34.21 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  25.44 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  34.9 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.74 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  29.78 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  28.65 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  32.64 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  30.07 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.82 
 
 		 281 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  24.87 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2185  hypothetical protein  28.28 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  27.78 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  24.24 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.32 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  26.16 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  30.49 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0536  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  23.56 
 
 		 314 aa  52  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  23.49 
 
 		 313 aa  52  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  26.38 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  29.12 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  24.06 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  26.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  26.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  25.77 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  32.19 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  26.99 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  27.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  27.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  26 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  25.9 
 
 		 289 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  27.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  27.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  27.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  27.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  26.88 
 
 		 278 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  28.07 
 
 		 298 aa  48.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>