167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4040 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  71.35 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  71.35 
 
 		 200 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  68.21 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  54.4 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  54.04 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  52.02 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  49.48 
 
 		 215 aa  188  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  47.15 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  44.1 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  47.4 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  47.4 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  50.26 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  42.71 
 
 		 257 aa  167  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  42.57 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  42.57 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  48.48 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  48.99 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  47.98 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  42.21 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  43.22 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  44.72 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  47.74 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  47.15 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  44.1 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  41 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  44.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  40.3 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  41.92 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  42.71 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  42.93 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  42.93 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  42.27 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  46.35 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  41.21 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  41.21 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  43.75 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  41.54 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  42.22 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  41.24 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  39.8 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  40.21 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  36.08 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  38 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  37.11 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  39.06 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  41.29 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  39.29 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  40.82 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  46.07 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  37.44 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  38.34 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  37.82 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  35.38 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  35.08 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  34.55 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  40.78 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  30.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  34.64 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  43.16 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  23.2 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.32 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  28.91 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.66 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  25.52 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  25.97 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  28.91 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  33.8 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  26.92 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  29.71 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  28.31 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  24.83 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.97 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  28.16 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  31.87 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0494  hypothetical protein  29.31 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  26.63 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  26.14 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  32.84 
 
 		 296 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2223  hypothetical protein  32 
 
 		 294 aa  51.6  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000101287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  24 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  25.45 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  24.86 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  25.79 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  25.86 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1588  Protein of unknown function DUF2179  31.79 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  0.342251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  26.21 
 
 		 290 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  27.27 
 
 		 287 aa  48.5  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2224  hypothetical protein  31.45 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00399664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0314  hypothetical protein  26.86 
 
 		 290 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4939  hypothetical protein  26.86 
 
 		 290 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  48.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4955  hypothetical protein  28.48 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4925  hypothetical protein  28.95 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4535  hypothetical protein  26.29 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.371592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4552  hypothetical protein  26.29 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  27.78 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  26.4 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>