137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0156 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  82.94 
 
 		 211 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  81.52 
 
 		 211 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  61.14 
 
 		 214 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  57.89 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  56.25 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  55.78 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  55.15 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  53.47 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  53.47 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  51.28 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  50.26 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  48.24 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  46.04 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  50.52 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  47.15 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  47.15 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  51.28 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  45.05 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  45.73 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  54.5 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  48.99 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  53.37 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  48.73 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  48.21 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  52.6 
 
 		 237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  48.48 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  48.22 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  45.5 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  46.23 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  45.02 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  42.93 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  50.78 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  48.19 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  44.39 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  45.08 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  41.75 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  43.78 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  49.76 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  42.56 
 
 		 234 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  42.13 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  45.64 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  46.11 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  46.07 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  43.52 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  42.71 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  48.17 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  41.15 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  43.43 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  41.45 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  41.97 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  39.02 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  37.24 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  38.74 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  41.01 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  44.67 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  44.68 
 
 		 109 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  30.06 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  34.81 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  33.14 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  33.12 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  32.69 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  31.41 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  27.72 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  28.09 
 
 		 288 aa  62  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  29.05 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  29.48 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  32.93 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  30.57 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  29.19 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  29.88 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  31.97 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  30.54 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  26.76 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  32.58 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  24 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2046  protein of unknown function DUF161  27.4 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.302347  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0017  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  29.17 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  29.45 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  27.17 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  31.21 
 
 		 296 aa  52  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  25.93 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  34.62 
 
 		 278 aa  52  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  26.98 
 
 		 296 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  26.32 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  28.21 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  30.53 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  28.57 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  27.33 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  28.44 
 
 		 313 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  25.84 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  28.29 
 
 		 283 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  24.44 
 
 		 297 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  29.76 
 
 		 286 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  23.23 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  27.63 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>