254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2849 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  75.69 
 
 
288 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  51.92 
 
 
289 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  50.87 
 
 
287 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  51.05 
 
 
287 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  48.28 
 
 
302 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0531  hypothetical protein  51.77 
 
 
290 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.686822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2543  hypothetical protein  46.91 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0209  protein of unknown function DUF161  50.53 
 
 
295 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.951556  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1873  protein of unknown function DUF161  43.17 
 
 
288 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.83834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  34.55 
 
 
299 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  33.85 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1913  hypothetical protein  38.46 
 
 
295 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  34.07 
 
 
290 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  32.97 
 
 
289 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  32.72 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  30.77 
 
 
278 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  32.38 
 
 
287 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  32.73 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  30.15 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  32.73 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  29.52 
 
 
278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  29.67 
 
 
278 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  32.01 
 
 
293 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  31.16 
 
 
290 aa  139  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  29.67 
 
 
278 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  31.11 
 
 
294 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  29.3 
 
 
278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  29.3 
 
 
278 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  29.3 
 
 
278 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  29.3 
 
 
278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  29.3 
 
 
278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  29.3 
 
 
278 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  31.29 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  28.94 
 
 
278 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  31.91 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  31.37 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  32.16 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  32.88 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  30.71 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  29.78 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  29.17 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  29.78 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0536  protein of unknown function DUF161  33.46 
 
 
294 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.95 
 
 
292 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  29.15 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  27.99 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  28.41 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  27.61 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  30.07 
 
 
311 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  29.56 
 
 
290 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  32.85 
 
 
290 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2215  protein of unknown function DUF161  30.71 
 
 
294 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00368135  hitchhiker  0.000374105 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  30.66 
 
 
290 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1419  hypothetical protein  34.81 
 
 
273 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  29.64 
 
 
296 aa  122  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  30.22 
 
 
278 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  30.88 
 
 
299 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  32.34 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  28.42 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  30.42 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  32.58 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  29.28 
 
 
292 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0641  hypothetical protein  29.35 
 
 
325 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2185  hypothetical protein  27.44 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  30.36 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  32 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  26.57 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  27.88 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  28.47 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  34.7 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  27.08 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  26.83 
 
 
287 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  26.5 
 
 
287 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2224  hypothetical protein  28.83 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00399664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1067  hypothetical protein  27.53 
 
 
333 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1062  hypothetical protein  27.53 
 
 
333 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1245  hypothetical protein  27.74 
 
 
285 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1072  hypothetical protein  26.83 
 
 
293 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1288  protein of unknown function DUF161  29.54 
 
 
293 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1171  hypothetical protein  28.1 
 
 
285 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  24.37 
 
 
322 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  27.37 
 
 
285 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3747  hypothetical protein  30.12 
 
 
269 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.960722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>