150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0284 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  45.88 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  46.35 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  43.39 
 
 		 204 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  42.22 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  41.3 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  39.58 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  40.84 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  39.9 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  38.02 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  39.41 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  37.22 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  37.56 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  37.56 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  37.78 
 
 		 257 aa  121  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  38.92 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  39.69 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  37.22 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  39.87 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  42.22 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  37.95 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  39.44 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  35 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  39.44 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  35.15 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  40 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  35.12 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  33.85 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  37.17 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  34.44 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  34.18 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  36.75 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  36.75 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  37.34 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  34.44 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  35.09 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  33.33 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  33.14 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  33.89 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  33.82 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  33.89 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  30.14 
 
 		 234 aa  92  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  33.88 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  91.7  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  36.41 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  35.16 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  41.91 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  37.18 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  33.33 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.81 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  26.83 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  26.26 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  29.27 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  27.47 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  29.67 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  24.87 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.65 
 
 		 322 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  25.97 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  27 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  26.5 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  28.29 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  29.03 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  28.32 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  32.29 
 
 		 109 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  31.14 
 
 		 313 aa  53.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  33.55 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  30.06 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  31.33 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  25.93 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  29.87 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  27.11 
 
 		 323 aa  51.6  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  32.97 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  26.53 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  27.73 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  28.12 
 
 		 289 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  32.93 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  21.88 
 
 		 294 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  24.65 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  25.87 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  24.65 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  28.44 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  23.57 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  23.57 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  29.71 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>