192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3641 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  91.67 
 
 
204 aa  380  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  77.94 
 
 
204 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  79.9 
 
 
204 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  66.49 
 
 
222 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  66.49 
 
 
222 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  55.56 
 
 
206 aa  235  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  57.95 
 
 
212 aa  225  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  53.47 
 
 
208 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  53.47 
 
 
208 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  52.74 
 
 
257 aa  221  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  51.44 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  52.24 
 
 
217 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  50.25 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  52.85 
 
 
209 aa  207  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  52.33 
 
 
215 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  49 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  50.26 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  49.22 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  50.26 
 
 
210 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  50.77 
 
 
209 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  51.03 
 
 
202 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  43.88 
 
 
235 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  50.26 
 
 
203 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  47.92 
 
 
203 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  48.69 
 
 
202 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  45.83 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  46.15 
 
 
202 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  45.64 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  47.32 
 
 
204 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  46.46 
 
 
211 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  46.91 
 
 
237 aa  177  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  42.36 
 
 
214 aa  174  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  45.45 
 
 
211 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  41.5 
 
 
228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  45.05 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  46.46 
 
 
200 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  41 
 
 
228 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  41.36 
 
 
238 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  45.96 
 
 
200 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  52.36 
 
 
233 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  42.56 
 
 
234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  44.56 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  43.52 
 
 
205 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  41.92 
 
 
201 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  39.09 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  44.79 
 
 
202 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  42.71 
 
 
198 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  43.46 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  40.62 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  38.02 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  40.41 
 
 
239 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.37 
 
 
215 aa  121  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  53.77 
 
 
109 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  34.72 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  36.67 
 
 
229 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  30.37 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  36.76 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  30.11 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  26.6 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  30.87 
 
 
288 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  28.88 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  30.77 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  28.11 
 
 
283 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.69 
 
 
295 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  30.97 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  30.81 
 
 
283 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  32.92 
 
 
296 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  30.37 
 
 
285 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  29.63 
 
 
285 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  27.23 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  30.86 
 
 
278 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  27.17 
 
 
322 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  28.57 
 
 
283 aa  61.6  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  29.11 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  25.37 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  22.56 
 
 
290 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  26.88 
 
 
314 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  31.43 
 
 
293 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  26.11 
 
 
287 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  26.82 
 
 
299 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.14 
 
 
311 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  27.03 
 
 
287 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  24.88 
 
 
293 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  24.64 
 
 
306 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  29.38 
 
 
285 aa  56.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  28.57 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  31.36 
 
 
292 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  29.61 
 
 
283 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>