More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0170 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 454 aa  934    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  88.94 
 
 		 454 aa  841    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  91.63 
 
 		 454 aa  866    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  88.27 
 
 		 454 aa  835    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 477 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  41.94 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  42.66 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  42.54 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  42.09 
 
 		 455 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  40.18 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 		 457 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  39.96 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  38.37 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  40.63 
 
 		 450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.27 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  39.01 
 
 		 458 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  37.39 
 
 		 450 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  37.39 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  37.61 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  37.16 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  37.02 
 
 		 446 aa  319  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  36.3 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  36.5 
 
 		 449 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  38.96 
 
 		 450 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  37 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  39.91 
 
 		 455 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  36.2 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  38.14 
 
 		 447 aa  297  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.27 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.17 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  36.34 
 
 		 483 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  38.36 
 
 		 456 aa  292  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  35.87 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.53 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  35.63 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  36.08 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 		 449 aa  285  9e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  36.06 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  38.29 
 
 		 451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.58 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  35.83 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  34.47 
 
 		 476 aa  282  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.17 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.03 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.03 
 
 		 450 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.09 
 
 		 476 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.07 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  34.9 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.48 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.62 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.62 
 
 		 452 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.62 
 
 		 452 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.62 
 
 		 452 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.62 
 
 		 452 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.62 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  33.48 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.39 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.25 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  37.98 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.25 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.25 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.19 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.02 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  33.73 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.83 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.51 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.26 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  34.7 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.64 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.79 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.76 
 
 		 490 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  32.64 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.77 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5067  fumarate lyase  35.47 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185188  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.25 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  33.79 
 
 		 431 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.68 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  34.94 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  34.47 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  34.61 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  35.1 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  33.33 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.91 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  32.62 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  33.98 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  32.72 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>