More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2058 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  52.5 
 
 
192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  48.67 
 
 
213 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  49.35 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  47.5 
 
 
210 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  54.35 
 
 
225 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  48.65 
 
 
231 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  46.36 
 
 
221 aa  134  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  40.7 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  43.24 
 
 
192 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  43.24 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  46.62 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  43.92 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  44.65 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  41.56 
 
 
274 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  47.83 
 
 
172 aa  124  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  44.44 
 
 
172 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.77 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  40 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  38.82 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  45.77 
 
 
282 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  38.46 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  40.12 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  38.64 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 
195 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.6 
 
 
178 aa  108  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  37.28 
 
 
210 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
239 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.9 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  40.4 
 
 
201 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 
209 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  41.67 
 
 
198 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  41.79 
 
 
189 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  40.15 
 
 
224 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  37.16 
 
 
217 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 
239 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
248 aa  104  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.35 
 
 
243 aa  104  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
239 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 
208 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 
208 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 
199 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 
237 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  40 
 
 
224 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.58 
 
 
210 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  41.61 
 
 
198 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  38.82 
 
 
223 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  37.59 
 
 
181 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 
207 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  43.08 
 
 
242 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.75 
 
 
186 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
259 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  41.35 
 
 
200 aa  99  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 
247 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.56 
 
 
189 aa  99  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  36.24 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  34.67 
 
 
175 aa  98.2  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.78 
 
 
238 aa  98.2  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.44 
 
 
260 aa  97.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 
259 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  45.38 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  36.42 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  36.36 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.79 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  33.55 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  40.44 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  42.64 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  37.76 
 
 
361 aa  95.9  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.62 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
250 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
241 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  38.1 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.52 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.07 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  36.88 
 
 
156 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  37.1 
 
 
246 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  35.96 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  36.18 
 
 
202 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  34.44 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  36.81 
 
 
410 aa  94  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  34.3 
 
 
184 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  36.65 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.94 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  34.36 
 
 
286 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>