55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2566 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  100 
 
 		 91 aa  179  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  75.56 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  51.85 
 
 		 79 aa  87.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  51.72 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  46.43 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  40.3 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  42.65 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  45.28 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  46.3 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  36.23 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  46.94 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  48.89 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  31.67 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  38.46 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  40.38 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  39.22 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  29.82 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2174  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3999  phage transcriptional regulator, AlpA  32.79 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 75 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  39.22 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 71 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  32.65 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  30.91 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  31.58 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 74 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 69 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 68 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>