More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0158 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
398 aa  803    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
394 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
366 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
374 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
377 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.21 
 
 
346 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
739 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
364 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
364 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
364 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
359 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
388 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
406 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
420 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
406 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
498 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
380 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.45 
 
 
407 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 
365 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
366 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
374 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  22.92 
 
 
377 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
750 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
412 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
411 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
378 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
385 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
376 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
360 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
348 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.91 
 
 
745 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
389 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
363 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
398 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.03 
 
 
359 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
381 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
360 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 
426 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
363 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
374 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.7 
 
 
408 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  37 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
392 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
378 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
386 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.17 
 
 
419 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  40.12 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
364 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
904 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
364 aa  94  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
389 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
401 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
828 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
353 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>