More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1766 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 305 aa  597  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  80.41 
 
 		 292 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  80.2 
 
 		 291 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  68.94 
 
 		 295 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  77.29 
 
 		 300 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  56.16 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  56.42 
 
 		 300 aa  315  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.24 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  51.86 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  46.76 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  52.76 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  51.37 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  52.74 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  51.41 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  50.68 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  50.18 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  50.18 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  51.64 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  49.66 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  54.74 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  51.37 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  51.57 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  53.33 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  48.43 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  51.76 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  50.7 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  48.41 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  47.15 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  43.27 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  48.94 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  45.74 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  41.04 
 
 		 398 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  41.63 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  41.41 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  45.89 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  38.03 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  40.68 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  40.68 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  41.63 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  41.84 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  46.64 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  44.68 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  43.36 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  41.61 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  41.28 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  39.69 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  41.31 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  45.33 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  44.68 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  38.16 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  40.47 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  38.65 
 
 		 499 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.49 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  36.23 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  33.9 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  36.21 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  32.85 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  33.9 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.67 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  33.9 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  32.08 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  34.86 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  35.75 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  34.86 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  34.46 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  32.26 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  33.52 
 
 		 511 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  35.03 
 
 		 516 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  35.03 
 
 		 516 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  31.22 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  33.96 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  33.33 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  33.9 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  33.33 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  35.27 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  36.11 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  35.03 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  31.96 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  28.15 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  37.99 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  32.27 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  31.19 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  34.81 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  33.9 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  35.23 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  34.46 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  28.12 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  34.46 
 
 		 510 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  35 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>