171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0474 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0474  hydrogenase nickel insertion protein HypA  100 
 
 
115 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.635429  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  70.27 
 
 
113 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  62.28 
 
 
114 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  63.39 
 
 
114 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  60.36 
 
 
113 aa  147  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  60.71 
 
 
114 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  60.71 
 
 
114 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  56.88 
 
 
109 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  56.88 
 
 
109 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  52.73 
 
 
112 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  50 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  49.09 
 
 
112 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  49.09 
 
 
110 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  47.22 
 
 
117 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  44.14 
 
 
111 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  44.95 
 
 
109 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  44.55 
 
 
110 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  44.95 
 
 
139 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  44.95 
 
 
139 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  45.45 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  43.12 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  44.55 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  45.13 
 
 
136 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  39.45 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  42.02 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  43.36 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.37 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2483  hydrogenase expression/synthesis HypA  40 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.17 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  45.13 
 
 
113 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  45.13 
 
 
113 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2541  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  43.36 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  43.36 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2006  hydrogenase expression/formation  47.42 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321644  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  35.14 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.59 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.71 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.61 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.17 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.17 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.17 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.27 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.82 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50490  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  42.7 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00363931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.97 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.96 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.34 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.96 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  36.28 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.44 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.65 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0505  hydrogenase expression/synthesis, HypA family  36.28 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2156  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.72 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.462739  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.2 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.74 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.46 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  39.29 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.09 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0331  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.61 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0315757  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.25 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3107  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2358  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.859502  normal  0.0379693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.21 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3397  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  38.05 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3492  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  38.05 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.919493  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3391  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  38.05 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.440327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3317  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  38.05 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000010148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3326  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  38.05 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651376  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.87 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.84 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.63 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2444  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1286  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812906  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.79 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.76 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.17 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7256  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.26 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492993  normal  0.319933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3905  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.33 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0533  putative hydrogenase expression/synthesis protein HypA  32.46 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  31.62 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4500  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.36 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.25 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1159  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3213  zinc finger protein  44.44 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1931  hydrogenase nickel incorporation protein  34.88 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350795  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.82 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.53 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>