More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1265 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  100 
 
 
342 aa  641    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  49.65 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  49.1 
 
 
327 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  43.71 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.51 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  42.25 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
350 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  44.72 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.5 
 
 
312 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  38.57 
 
 
309 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.34 
 
 
342 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 
325 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  40.33 
 
 
317 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.85 
 
 
324 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  41.88 
 
 
309 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  36.62 
 
 
315 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  39.39 
 
 
336 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 
342 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.37 
 
 
334 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  45.66 
 
 
313 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  43.64 
 
 
332 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  44.38 
 
 
319 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
329 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  42.48 
 
 
332 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 
326 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  38.64 
 
 
350 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  41.08 
 
 
333 aa  186  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  39.4 
 
 
333 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  41.5 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  40.53 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  43.89 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  42.96 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.85 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.68 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.97 
 
 
306 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  36.62 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.68 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.68 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.51 
 
 
310 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.51 
 
 
310 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 
334 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
310 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 
329 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  39.33 
 
 
342 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
334 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
835 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
334 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  40 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.22 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 
346 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  42.66 
 
 
333 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.51 
 
 
331 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  39.38 
 
 
324 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.91 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.1 
 
 
327 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  43.21 
 
 
323 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
319 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  37.31 
 
 
335 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  40.2 
 
 
310 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  39.55 
 
 
322 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 
341 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.39 
 
 
327 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.83 
 
 
334 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.76 
 
 
348 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  40.56 
 
 
335 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  41.87 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.3 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.3 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.74 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.3 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.3 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  36.26 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  39.36 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  41.12 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  42.4 
 
 
314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  42.09 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.55 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  38.63 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  41.27 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>