More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1484 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
138 aa  284  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
258 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.38 
 
 
270 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 
138 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.45 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  43.97 
 
 
142 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.62 
 
 
143 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.11 
 
 
139 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  39.57 
 
 
248 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.71 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.57 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.34 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  54.22 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.64 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  41.51 
 
 
258 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
257 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
145 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.22 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.22 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
258 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  41.26 
 
 
167 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  41.12 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
177 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.94 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  44.25 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  41.26 
 
 
166 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.83 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.38 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.65 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  42.06 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  44.32 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.9 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  44.86 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.12 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.74 
 
 
588 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  35.97 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  38.24 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  39.81 
 
 
164 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  44.57 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.51 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.86 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.86 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  37.5 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  43.33 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
269 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.99 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
299 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  42.59 
 
 
170 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.66 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.93 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  40.19 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  36.69 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  35.46 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  35.29 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
276 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  40.19 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.76 
 
 
299 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  32.35 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  36.62 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.35 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  40.37 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.14 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  35.56 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  35.43 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1017  protein tyrosine phosphatase  42.2 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246391  normal  0.0984563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>