166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5046 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  100 
 
 
347 aa  724    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  58.28 
 
 
333 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  52.38 
 
 
329 aa  359  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  53.85 
 
 
330 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  53.14 
 
 
318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  50.48 
 
 
316 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  50.48 
 
 
316 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  51.12 
 
 
316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  50.64 
 
 
315 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  51.62 
 
 
465 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  49.52 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  49.52 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  51.58 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  51.58 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  49.68 
 
 
316 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  48.55 
 
 
316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.55 
 
 
316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.55 
 
 
316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  46.96 
 
 
314 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 
328 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  48.66 
 
 
233 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  48.66 
 
 
233 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
319 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  37.8 
 
 
326 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
315 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
350 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  36.81 
 
 
319 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  35.26 
 
 
314 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  33.44 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  34.86 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  34.56 
 
 
325 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  33.85 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  46.58 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  46.58 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.27 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
373 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
398 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  29.13 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  30.77 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  25.51 
 
 
393 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
460 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  29.17 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
439 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
424 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  18.7 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
414 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.83 
 
 
381 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.83 
 
 
381 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.83 
 
 
381 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  20.51 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
392 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
394 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
387 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
379 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
413 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
423 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
363 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
395 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
418 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
374 aa  46.6  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
430 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.4 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>