More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4013 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  54.62 
 
 		 1072 aa  1157    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  59.35 
 
 		 1075 aa  1285    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1052 aa  2139    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  52.71 
 
 		 1104 aa  1149    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  52.22 
 
 		 1086 aa  1154    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  58.55 
 
 		 1087 aa  1250    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  52.82 
 
 		 1095 aa  1149    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1072 aa  641    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.81 
 
 		 1460 aa  1235    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.7 
 
 		 1060 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 		 1060 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  32.66 
 
 		 1061 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1064 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.71 
 
 		 1056 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1073 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1078 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 		 1052 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  34.61 
 
 		 1064 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1082 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1055 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1084 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1082 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1084 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1068 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1084 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1082 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1068 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1064 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1065 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1055 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1055 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1076 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1055 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1076 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.87 
 
 		 1082 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1084 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 1057 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.33 
 
 		 1063 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1082 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1072 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1055 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1055 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 		 1072 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1072 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  32.55 
 
 		 1064 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  33.74 
 
 		 1057 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 		 1055 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  32.14 
 
 		 1081 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1044 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1065 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 		 1057 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1064 aa  562  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1065 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1061 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1058 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.72 
 
 		 1462 aa  549  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.59 
 
 		 1049 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1080 aa  539  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1076 aa  536  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1076 aa  535  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1070 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1109 aa  506  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1090 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1087 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.94 
 
 		 1496 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1043 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1032 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1041 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1050 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1470 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1034 aa  393  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1034 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1011 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1039 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1023 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1040 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1044 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1055 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1065 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1046 aa  373  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1059 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1054 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1054 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1054 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1036 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1070 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1043 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1095 aa  366  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.83 
 
 		 1024 aa  365  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1039 aa  364  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1058 aa  363  7.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.79 
 
 		 1049 aa  362  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1028 aa  362  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.38 
 
 		 1050 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1034 aa  358  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1028 aa  357  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1071 aa  356  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1051 aa  354  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1063 aa  354  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1066 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>