More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0434 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  100 
 
 		 522 aa  1066    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.57 
 
 		 619 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  46.1 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  45.25 
 
 		 583 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 		 543 aa  475  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.62 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.76 
 
 		 613 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.96 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  45.83 
 
 		 543 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 		 539 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  44.39 
 
 		 624 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  45.57 
 
 		 531 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  43.76 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 		 629 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.57 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.75 
 
 		 547 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.63 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  45.95 
 
 		 542 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.43 
 
 		 562 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  45.79 
 
 		 542 aa  465  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.74 
 
 		 633 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.82 
 
 		 553 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 627 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  46.14 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.27 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  45.68 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  45.2 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  42.99 
 
 		 613 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  45.01 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  45.95 
 
 		 542 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  45.12 
 
 		 599 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  47.04 
 
 		 568 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.09 
 
 		 615 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 637 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.2 
 
 		 592 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.99 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  46.58 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.05 
 
 		 542 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  47.15 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  46.09 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  45.86 
 
 		 544 aa  458  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 539 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.57 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 		 550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  43.45 
 
 		 640 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 		 633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 		 629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.34 
 
 		 611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  43.93 
 
 		 611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  43.82 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  44.4 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.63 
 
 		 542 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  44.44 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  46.11 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 		 625 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  44.58 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  45.07 
 
 		 537 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 540 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.72 
 
 		 533 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.19 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  44.92 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.58 
 
 		 617 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 633 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  43.33 
 
 		 640 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.14 
 
 		 632 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  44.92 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.33 
 
 		 640 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.86 
 
 		 571 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  45.05 
 
 		 586 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.47 
 
 		 534 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43.66 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.26 
 
 		 634 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  44.72 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.4 
 
 		 537 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.26 
 
 		 634 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.73 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 		 633 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.81 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  44.16 
 
 		 543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  43.21 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.11 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.49 
 
 		 634 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  41.89 
 
 		 573 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41.76 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.22 
 
 		 609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 		 631 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  45.54 
 
 		 537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  45.47 
 
 		 524 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  41.83 
 
 		 612 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  41.76 
 
 		 623 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.46 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>