64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0138 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
527 aa  1087    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  33.76 
 
 
798 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 
804 aa  256  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  30.97 
 
 
781 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  30.08 
 
 
806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  30 
 
 
824 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.53 
 
 
851 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.27 
 
 
826 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.18 
 
 
826 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  27.49 
 
 
824 aa  183  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  24.95 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  26.07 
 
 
815 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  26.24 
 
 
796 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.14 
 
 
792 aa  173  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  27.4 
 
 
790 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  26.91 
 
 
823 aa  170  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.91 
 
 
823 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  26.91 
 
 
823 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  26.91 
 
 
792 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  26.69 
 
 
808 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  26.69 
 
 
792 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  26.69 
 
 
823 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.33 
 
 
833 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  26.69 
 
 
823 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.65 
 
 
821 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  26.69 
 
 
792 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  26.69 
 
 
808 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  36.92 
 
 
680 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  34.15 
 
 
697 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
764 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.5 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3169  protein serine/threonine phosphatase  21.63 
 
 
238 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00870401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1701  protein serine/threonine phosphatase  22.37 
 
 
253 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.93 
 
 
391 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  22.41 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.88 
 
 
644 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25 
 
 
606 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  24.34 
 
 
642 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  28.39 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  21.56 
 
 
235 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  23.04 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  25 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  25 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  25 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  23.58 
 
 
660 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.77 
 
 
941 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  22.54 
 
 
658 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  21.57 
 
 
590 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  20.42 
 
 
648 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  22.63 
 
 
262 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  25.69 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  24.14 
 
 
683 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  20.1 
 
 
251 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  20.68 
 
 
631 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.7 
 
 
464 aa  44.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  24.38 
 
 
451 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.28 
 
 
957 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  26.15 
 
 
412 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  19.4 
 
 
379 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  20.69 
 
 
705 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
383 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  21.32 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  21.72 
 
 
563 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  23.83 
 
 
521 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>