More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1391 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1391  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018666  unclonable  0.00000780162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  71.95 
 
 		 94 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  65.43 
 
 		 93 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  64.2 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  40.24 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  37.8 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  39.13 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  36.99 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  39.73 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.42 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  44 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  32.47 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  43.08 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.42 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  34.72 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  31.94 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 297 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  39.06 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  36.23 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 234 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.91 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.91 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  41.54 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>