More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0095 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  66.87 
 
 		 490 aa  686    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 494 aa  1020    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  48.41 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  39.23 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  38.82 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  39.72 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 		 488 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 		 688 aa  312  9e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 533 aa  286  9e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 		 523 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  42.41 
 
 		 514 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  37.32 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.67 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.67 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  32.73 
 
 		 662 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 		 509 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.87 
 
 		 633 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  25.69 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 905 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 1124 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 889 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  31.02 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  29.5 
 
 		 666 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.87 
 
 		 661 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  30.86 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_25890  predicted protein  28.28 
 
 		 825 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.422329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 899 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 502 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  29.46 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 919 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 889 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  29.41 
 
 		 895 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 944 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  27.65 
 
 		 672 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 868 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.87 
 
 		 672 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  29.8 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.51 
 
 		 672 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 		 895 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.11 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.5 
 
 		 664 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  28.62 
 
 		 740 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.14 
 
 		 822 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  30.38 
 
 		 475 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  26.4 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.57 
 
 		 794 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.5 
 
 		 664 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.21 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.25 
 
 		 834 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.25 
 
 		 831 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 1231 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 889 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.32 
 
 		 737 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 1101 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 642 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 772 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.79 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.79 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.17 
 
 		 804 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 885 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  26.62 
 
 		 501 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 1118 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.25 
 
 		 810 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.29 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  26.3 
 
 		 869 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.16 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 678 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.08 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.63 
 
 		 718 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.33 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  26.72 
 
 		 433 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.77 
 
 		 1099 aa  96.7  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.63 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.42 
 
 		 980 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  29.96 
 
 		 788 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  24 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>