More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0067 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.59 
 
 		 137 aa  207  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.04 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.82 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.96 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.49 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.74 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 150 aa  151  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 151 aa  143  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.28 
 
 		 150 aa  143  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 193 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  50.76 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.28 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 151 aa  139  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.55 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  137  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.38 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  50.76 
 
 		 166 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 193 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 193 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.38 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>