More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0031 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  38.21 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  39.81 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  40.18 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  40.54 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  38.71 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  43.24 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  40.87 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.67 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  40.87 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.32 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  39.5 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  44.21 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  40.91 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.38 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  34.78 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  37.7 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  34.38 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  41.74 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>