More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2157 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
232 aa  490  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  82.61 
 
 
232 aa  407  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  80.6 
 
 
232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  79.74 
 
 
232 aa  400  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  79.91 
 
 
231 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  78.35 
 
 
233 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  74.03 
 
 
233 aa  377  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.11 
 
 
237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.49 
 
 
237 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.93 
 
 
226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.28 
 
 
228 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  35.24 
 
 
228 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.77 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.77 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.38 
 
 
228 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.59 
 
 
229 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.51 
 
 
229 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.73 
 
 
233 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.27 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  32.17 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.89 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.07 
 
 
232 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.86 
 
 
253 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.76 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.97 
 
 
233 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.02 
 
 
233 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.14 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.52 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.74 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.11 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.83 
 
 
237 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.05 
 
 
233 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.64 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.5 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  31.3 
 
 
235 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.84 
 
 
251 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.58 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.51 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.11 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.49 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.26 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.41 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.95 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.24 
 
 
222 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.31 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.84 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.84 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.05 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.62 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  33.93 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.21 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.15 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.59 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  42.5 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.76 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
301 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.37 
 
 
434 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.02 
 
 
250 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.85 
 
 
201 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  35.4 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.58 
 
 
390 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.08 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
415 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  26.81 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  26.81 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.37 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  30.99 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.22 
 
 
394 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
575 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.64 
 
 
438 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  28.69 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
199 aa  55.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  31.47 
 
 
222 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  41.43 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.15 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  36.71 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.26 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>