More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1519 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 600 aa  648    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  80.81 
 
 		 608 aa  1023    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 590 aa  669    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  82.14 
 
 		 604 aa  1047    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  82.8 
 
 		 605 aa  1038    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 607 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 604 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 606 aa  677    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 590 aa  676    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  84.64 
 
 		 601 aa  1065    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 599 aa  689    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 614 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 619 aa  677    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 625 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 605 aa  643    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 595 aa  697    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 605 aa  1249    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  82.51 
 
 		 608 aa  1031    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  81.65 
 
 		 606 aa  1046    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 593 aa  709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 604 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 604 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 590 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 604 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 609 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 590 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 590 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 593 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 591 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 595 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 588 aa  612  9.999999999999999e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 595 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 591 aa  605  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 623 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 623 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 601 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 603 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 597 aa  548  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 592 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 597 aa  535  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 592 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 598 aa  527  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 598 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 588 aa  524  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 598 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 592 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 593 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 589 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 595 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 598 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 619 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 590 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 608 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 591 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 591 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 591 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 583 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 591 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 591 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 591 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 592 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 591 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 591 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 600 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 590 aa  502  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 594 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 591 aa  505  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 591 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 583 aa  505  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>