More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0422 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
149 aa  309  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  85.23 
 
 
149 aa  273  6e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  85.91 
 
 
149 aa  272  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  82.55 
 
 
149 aa  265  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  78.52 
 
 
149 aa  259  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  79.19 
 
 
151 aa  258  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  77.18 
 
 
150 aa  255  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 
144 aa  193  8e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.15 
 
 
144 aa  188  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.57006e-06  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
145 aa  187  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.18025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  60.84 
 
 
147 aa  187  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  58.74 
 
 
149 aa  187  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  61.11 
 
 
148 aa  187  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  9.65518e-09  hitchhiker  9.92925e-11 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  60.84 
 
 
145 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
147 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
147 aa  184  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
147 aa  182  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
144 aa  182  1e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  182  1e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  65.19 
 
 
143 aa  182  2e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  59.56 
 
 
148 aa  181  2e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
144 aa  182  2e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 
143 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  181  4e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  1.37696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
147 aa  181  4e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  180  5e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.87 
 
 
142 aa  180  5e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  59.12 
 
 
147 aa  180  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
147 aa  180  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  180  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 
143 aa  179  9e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
170 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
142 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  57.34 
 
 
145 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-05  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  178  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
151 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
150 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 
143 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.58972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  53.85 
 
 
147 aa  178  3e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
147 aa  178  3e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  178  3e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
150 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
150 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
151 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
151 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
142 aa  177  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
151 aa  177  5e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 
143 aa  177  5e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  57.89 
 
 
150 aa  177  5e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 
143 aa  177  5e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
147 aa  177  6e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  57.89 
 
 
150 aa  177  6e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  176  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.33795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  56.93 
 
 
148 aa  176  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.40761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  176  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  176  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 
146 aa  176  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  53.79 
 
 
150 aa  176  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  1.46493e-06  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  59.12 
 
 
147 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 
145 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 
143 aa  175  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 
149 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  54.79 
 
 
151 aa  175  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  53.85 
 
 
147 aa  175  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  54.93 
 
 
146 aa  174  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.19663e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  174  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
142 aa  174  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
151 aa  174  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  174  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  53.85 
 
 
154 aa  174  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
144 aa  173  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.46357e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
142 aa  173  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.82809e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 
144 aa  173  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.19018e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 
146 aa  173  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 
144 aa  172  1e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  56.2 
 
 
147 aa  172  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  172  1e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
147 aa  172  1e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.58182e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 
145 aa  172  1e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  172  2e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.21803e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
142 aa  172  2e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  171  2e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  172  2e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.05698e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  171  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
145 aa  171  2e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.05629e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  171  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>