52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0250 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  70.62 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  48.7 
 
 		 190 aa  185  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  46.32 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  45.45 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  42.78 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  40.32 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  39.22 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  41.9 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  38.12 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  34 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  35.81 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  35.89 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  34.38 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  37.36 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  34.14 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  37.88 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  34.11 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.6 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  32.64 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  31.72 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  31.17 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.12 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  33.18 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  33.99 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30.7 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.97 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  30.38 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.02 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  35.03 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  35.03 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  29.63 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  27.14 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  28.81 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  25.45 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.6 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  33.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  33.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  33.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  33.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  39.29 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  39.24 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2861  hypothetical protein  26.86 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  28.65 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 409 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  24.2 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  29.57 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1131  major outer membrane protein OMP-1Y  29.85 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  29.27 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>