52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0250 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 
215 aa  430  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.37774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  70.62 
 
 
190 aa  253  1e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  4.33571e-07  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  48.7 
 
 
190 aa  185  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  1.02603e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  46.32 
 
 
195 aa  152  3e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  9.82114e-11  unclonable  6.60987e-07 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  45.45 
 
 
183 aa  140  1e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  42.78 
 
 
206 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  40.32 
 
 
186 aa  130  2e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  39.22 
 
 
202 aa  129  4e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  41.9 
 
 
195 aa  127  9e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  38.12 
 
 
202 aa  119  4e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.93309e-08  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  34 
 
 
201 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  35.81 
 
 
227 aa  108  4e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  35.89 
 
 
203 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  1.6508e-06  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  34.38 
 
 
222 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.64582e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  37.36 
 
 
196 aa  101  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  5.83804e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  34.14 
 
 
243 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.19065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  37.88 
 
 
194 aa  98.6  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  34.11 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.6 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.77895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  32.64 
 
 
237 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.65073e-06  hitchhiker  3.18846e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  31.72 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  31.17 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  3.21544e-08  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.12 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  33.18 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.66058e-13 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  33.99 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30.7 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.97 
 
 
249 aa  83.6  2e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.60026e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  30.38 
 
 
234 aa  82.8  4e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.21027e-11  unclonable  2.18864e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.02 
 
 
224 aa  80.1  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  35.03 
 
 
181 aa  79  5e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  29.63 
 
 
197 aa  77.4  1e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  4.99206e-11  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  35.03 
 
 
181 aa  77.8  1e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  27.14 
 
 
364 aa  59.7  4e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  28.81 
 
 
263 aa  58.9  5e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 
359 aa  58.5  8e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  25.45 
 
 
231 aa  57.8  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  4.90319e-08  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.6 
 
 
245 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  33.61 
 
 
239 aa  54.7  9e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  33.61 
 
 
239 aa  54.7  9e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  33.61 
 
 
239 aa  54.7  9e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  33.61 
 
 
239 aa  54.7  9e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  39.29 
 
 
219 aa  53.5  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  39.24 
 
 
237 aa  50.4  2e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2861  hypothetical protein  26.86 
 
 
184 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.33 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.33 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  28.65 
 
 
229 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
409 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  24.2 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  29.57 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  9.70612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  29.27 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1131  major outer membrane protein OMP-1Y  29.85 
 
 
285 aa  42.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>