More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02320 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  60.4 
 
 		 840 aa  1020    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  100 
 
 		 828 aa  1706    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  54.72 
 
 		 825 aa  898    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  37.32 
 
 		 876 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  34.55 
 
 		 847 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  36.61 
 
 		 838 aa  425  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.29 
 
 		 836 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  35.54 
 
 		 835 aa  419  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  33.86 
 
 		 862 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.64 
 
 		 848 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.04 
 
 		 839 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  33.9 
 
 		 835 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  32.07 
 
 		 872 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  32.44 
 
 		 810 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  30.65 
 
 		 783 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  31.09 
 
 		 783 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29.05 
 
 		 826 aa  340  8e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.44 
 
 		 817 aa  330  9e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  32.28 
 
 		 852 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  31.9 
 
 		 832 aa  325  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  31.65 
 
 		 783 aa  325  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  36.11 
 
 		 886 aa  323  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.05 
 
 		 837 aa  323  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  32.41 
 
 		 823 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  30.75 
 
 		 835 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  29.92 
 
 		 783 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  30.17 
 
 		 878 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  30.92 
 
 		 877 aa  294  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  29.82 
 
 		 767 aa  291  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.63 
 
 		 841 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  38.06 
 
 		 835 aa  281  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  36.78 
 
 		 839 aa  280  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  30.99 
 
 		 805 aa  279  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  30.46 
 
 		 834 aa  278  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  37.39 
 
 		 873 aa  272  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  29.76 
 
 		 826 aa  271  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  30.15 
 
 		 833 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  29.89 
 
 		 843 aa  266  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  33.95 
 
 		 851 aa  253  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  30.13 
 
 		 847 aa  253  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  28.61 
 
 		 723 aa  252  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  34.77 
 
 		 822 aa  251  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  28.75 
 
 		 818 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  40.71 
 
 		 746 aa  246  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.96 
 
 		 790 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  28.57 
 
 		 722 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  33.21 
 
 		 629 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  33.97 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  25.68 
 
 		 736 aa  238  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  32.86 
 
 		 790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  31.21 
 
 		 621 aa  233  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.05 
 
 		 792 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  24.42 
 
 		 716 aa  232  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  32.58 
 
 		 622 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  35.59 
 
 		 406 aa  230  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  34.48 
 
 		 411 aa  229  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  36.99 
 
 		 696 aa  227  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  35.13 
 
 		 792 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  36.34 
 
 		 419 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  33.98 
 
 		 790 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  39.3 
 
 		 403 aa  225  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  37.83 
 
 		 404 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  35.99 
 
 		 411 aa  221  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  39.61 
 
 		 404 aa  217  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  32.39 
 
 		 409 aa  217  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  41.18 
 
 		 409 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  36.89 
 
 		 746 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  31.17 
 
 		 638 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  38.19 
 
 		 747 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  25.9 
 
 		 805 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.39 
 
 		 406 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  32.13 
 
 		 654 aa  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  33.92 
 
 		 405 aa  214  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  32.13 
 
 		 654 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  32.13 
 
 		 654 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  32.13 
 
 		 654 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  33.27 
 
 		 672 aa  213  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  32.13 
 
 		 654 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  32.13 
 
 		 654 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  26.73 
 
 		 757 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  32.67 
 
 		 639 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  31.41 
 
 		 655 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.28 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  30.63 
 
 		 638 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  32.51 
 
 		 640 aa  211  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  35.45 
 
 		 407 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  38.13 
 
 		 410 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  31.31 
 
 		 638 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  30.43 
 
 		 653 aa  208  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  34.17 
 
 		 426 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  41.82 
 
 		 439 aa  209  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  30.43 
 
 		 653 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  30.43 
 
 		 653 aa  208  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  30.43 
 
 		 653 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  30.43 
 
 		 667 aa  207  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  39.38 
 
 		 413 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  35.81 
 
 		 637 aa  207  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  39.26 
 
 		 406 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  35.78 
 
 		 638 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  30.43 
 
 		 667 aa  207  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>