81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0069 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  100 
 
 		 517 aa  1071    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  20.36 
 
 		 498 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  22.1 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  22.67 
 
 		 491 aa  80.1  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  22.07 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  21.59 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  21.85 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  21.85 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  21.85 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  21.03 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  23.13 
 
 		 675 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  21.73 
 
 		 663 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 637 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  21.23 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  18.85 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  18.85 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  18.85 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.77 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  20.53 
 
 		 701 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  20.53 
 
 		 684 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  21.9 
 
 		 311 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  21.9 
 
 		 311 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  21.61 
 
 		 797 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  21.61 
 
 		 797 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  21.61 
 
 		 797 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  24.66 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  22.47 
 
 		 317 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  21.29 
 
 		 294 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 568 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  27.07 
 
 		 341 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  25.74 
 
 		 318 aa  47  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  21.6 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  22.02 
 
 		 296 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  22.5 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  22.5 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  22.5 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  22.5 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  22.5 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  22.5 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  25 
 
 		 806 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  25.15 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 311 aa  46.6  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.4 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  22.22 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.85 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  26.29 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  21.13 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  21.9 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.43 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  19.86 
 
 		 827 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  23.59 
 
 		 332 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  23.98 
 
 		 304 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.58 
 
 		 330 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  22.09 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  22.09 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  27.12 
 
 		 337 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.63 
 
 		 336 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  30.5 
 
 		 275 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.55 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.58 
 
 		 299 aa  44.7  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.16 
 
 		 315 aa  44.3  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  27.61 
 
 		 297 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  21.94 
 
 		 277 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  21.88 
 
 		 308 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4231  integrase/recombinase  22.35 
 
 		 322 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  23.14 
 
 		 298 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  26.95 
 
 		 182 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  21.21 
 
 		 301 aa  43.5  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  23.35 
 
 		 333 aa  43.5  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 302 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>