21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0583 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  100 
 
 		 517 aa  1072    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  100 
 
 		 517 aa  1072    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  100 
 
 		 517 aa  1072    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  31.99 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  32.79 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 533 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  29.01 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.52 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  27.69 
 
 		 526 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  26.67 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  25.19 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  25.56 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  27.86 
 
 		 342 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  26.91 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  22.22 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  23 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  23.53 
 
 		 526 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2176  hypothetical protein  24.79 
 
 		 548 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  22.09 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>