22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0516 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  100 
 
 		 521 aa  1071    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  36.59 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  37.76 
 
 		 513 aa  247  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  32.79 
 
 		 517 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  32.79 
 
 		 517 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  32.79 
 
 		 517 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  33.95 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  32.9 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  29.65 
 
 		 434 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  27.23 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  26.64 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  27.13 
 
 		 342 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.4 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 502 aa  87.4  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  26.78 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  28.16 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4012  hypothetical protein  23.42 
 
 		 559 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  22.48 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  27.13 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  27.13 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>