26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2290 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  100 
 
 		 515 aa  1056    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  31.61 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  27.84 
 
 		 513 aa  160  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  31.45 
 
 		 342 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  27.03 
 
 		 521 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  26.67 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  26.67 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  28.16 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.78 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  27.61 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  25.37 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4986  Phage integrase  30.39 
 
 		 527 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  26.83 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  27.78 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5179  integrase family protein  28.57 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  28.25 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  24.68 
 
 		 526 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  31.06 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  31.06 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.94 
 
 		 307 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  32.94 
 
 		 307 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  23.98 
 
 		 309 aa  43.9  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>