21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1125 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  100 
 
 		 533 aa  1105    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  39.33 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  36.59 
 
 		 521 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  31.34 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  31.34 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  30.38 
 
 		 434 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  32.01 
 
 		 526 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  28.4 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.44 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  26.35 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  24.36 
 
 		 531 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  25.81 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  21.71 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  29.01 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  27.47 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  24.47 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  28.17 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  28.17 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2176  hypothetical protein  23.11 
 
 		 548 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>