16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01692 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1070    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1070    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4986  Phage integrase  53.89 
 
 		 527 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5179  integrase family protein  53.47 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  23.9 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 533 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  31.06 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  28.4 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  28.77 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  24.16 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  23.53 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  27.13 
 
 		 521 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  38.55 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  38.55 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  38.55 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  35.85 
 
 		 291 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>