23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0329 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  100 
 
 		 513 aa  1057    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  39.33 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  37.76 
 
 		 521 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  31.99 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  31.99 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  31.99 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  34.38 
 
 		 434 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  31.95 
 
 		 436 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  27.84 
 
 		 515 aa  160  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  30.89 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.21 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  29.22 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  29.65 
 
 		 342 aa  130  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 502 aa  126  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  24.66 
 
 		 531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  30.57 
 
 		 337 aa  90.9  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  28 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2176  hypothetical protein  22.47 
 
 		 548 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  22.54 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0087  hypothetical protein  23.51 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  24.58 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  24.58 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>