20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4604 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 531 aa  1105    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  24.66 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  28.21 
 
 		 521 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 533 aa  114  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  25.56 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  25.56 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  26.61 
 
 		 526 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  30.72 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  21.43 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  24.44 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  24.76 
 
 		 579 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  26.83 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.5 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4012  hypothetical protein  25.13 
 
 		 559 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  22.6 
 
 		 526 aa  43.5  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>