55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0191 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  100 
 
 		 568 aa  1177    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 624 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 624 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 624 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.14 
 
 		 624 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.14 
 
 		 624 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.14 
 
 		 624 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  22.96 
 
 		 645 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  22.95 
 
 		 616 aa  84  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  22.5 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  22.64 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  26.94 
 
 		 707 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.62 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  24.03 
 
 		 627 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  24.03 
 
 		 627 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  24.03 
 
 		 627 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  22.47 
 
 		 713 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  28.69 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.79 
 
 		 650 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  22.7 
 
 		 533 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  23.88 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.07 
 
 		 650 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  23.88 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.13 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 308 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  25.75 
 
 		 325 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  25.17 
 
 		 517 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5045  hypothetical protein  24.28 
 
 		 694 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0423827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.4 
 
 		 498 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  37.68 
 
 		 289 aa  47.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  35.85 
 
 		 324 aa  47.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 724 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 724 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 724 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.95 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 305 aa  45.8  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  24.07 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  28 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.26 
 
 		 313 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  28.3 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.69 
 
 		 275 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 323 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3586  hypothetical protein  31.58 
 
 		 413 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  30.86 
 
 		 210 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  24.68 
 
 		 384 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  25.13 
 
 		 295 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  27.57 
 
 		 721 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 312 aa  43.5  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>