41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4224 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3586  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  854    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  100 
 
 		 707 aa  1467    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  99.65 
 
 		 289 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  37.02 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  36.88 
 
 		 683 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00539  hypothetical protein  28.66 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25.91 
 
 		 688 aa  178  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  24.72 
 
 		 616 aa  95.1  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03073  hypothetical protein  25.45 
 
 		 402 aa  93.6  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  25.64 
 
 		 627 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  25.64 
 
 		 627 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  25.64 
 
 		 627 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  27.78 
 
 		 631 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  22.71 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 600 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 600 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  24.02 
 
 		 680 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  24.02 
 
 		 680 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.78 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.63 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  24.6 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  24.6 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  20.99 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  19.23 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 236 aa  63.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  24.04 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.15 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.78 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.22 
 
 		 650 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  24.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  24.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  24.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  24.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  24.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  24.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 741 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  25.52 
 
 		 721 aa  50.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  24.24 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  23.95 
 
 		 713 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  24.47 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>