34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4142 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  57.68 
 
 
714 aa  820    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  100 
 
 
713 aa  1454    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  49.09 
 
 
721 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  46.74 
 
 
724 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  46.74 
 
 
724 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  46.74 
 
 
724 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  45.3 
 
 
741 aa  555  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  45.3 
 
 
717 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  37.47 
 
 
645 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  31.93 
 
 
693 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  26.83 
 
 
714 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  27.23 
 
 
731 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  27.23 
 
 
731 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  24.93 
 
 
707 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  25.47 
 
 
709 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  26.86 
 
 
572 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  26.35 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  26.35 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  26.35 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  26.35 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  26.35 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  26.35 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25.14 
 
 
688 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  42.42 
 
 
104 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  42.42 
 
 
104 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.642999 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  24.77 
 
 
616 aa  54.7  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  22.47 
 
 
568 aa  54.3  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6008  hypothetical protein  30.69 
 
 
100 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5426  hypothetical protein  30.69 
 
 
100 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.705268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  23.95 
 
 
707 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  23.39 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  23.39 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  24.26 
 
 
683 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  23.76 
 
 
683 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>