22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6753 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 650 aa  1326    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  93.84 
 
 		 650 aa  1243    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  85.67 
 
 		 650 aa  1148    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.56 
 
 		 617 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  27.39 
 
 		 606 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  25 
 
 		 600 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  25 
 
 		 600 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  23.82 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  26.25 
 
 		 533 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  24.96 
 
 		 616 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  32.89 
 
 		 236 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  22.35 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  22.35 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  25.15 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  22.47 
 
 		 683 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  22.47 
 
 		 683 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  35.79 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  22.12 
 
 		 392 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.35 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  23.63 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 694 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>