20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2364 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 729 aa  1529    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  32.49 
 
 		 694 aa  349  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  23.87 
 
 		 683 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  23.87 
 
 		 683 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  22.13 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  21.63 
 
 		 707 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  26.38 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  23.55 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  23.55 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  24.24 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  30 
 
 		 627 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  30 
 
 		 627 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  30 
 
 		 627 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  28.92 
 
 		 631 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00539  hypothetical protein  22.22 
 
 		 475 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.35 
 
 		 650 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  23.42 
 
 		 616 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  22.42 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  22.42 
 
 		 619 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03073  hypothetical protein  22.62 
 
 		 402 aa  44.3  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>