21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7326 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  100 
 
 		 627 aa  1295    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  100 
 
 		 627 aa  1295    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  100 
 
 		 627 aa  1295    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  83.78 
 
 		 631 aa  1097    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  35.13 
 
 		 531 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  24.64 
 
 		 682 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  25.64 
 
 		 707 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  23.79 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  26.07 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  26.07 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 694 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  25.27 
 
 		 289 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30 
 
 		 729 aa  54.7  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3586  hypothetical protein  35 
 
 		 413 aa  51.6  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03073  hypothetical protein  23.72 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  27.14 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  23.78 
 
 		 600 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  23.78 
 
 		 600 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  29.22 
 
 		 721 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>