28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4252 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  100 
 
 		 694 aa  1456    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.49 
 
 		 729 aa  349  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  22.33 
 
 		 683 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  22.33 
 
 		 683 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  22.71 
 
 		 707 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25.61 
 
 		 688 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  26.24 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  27.48 
 
 		 627 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  27.48 
 
 		 627 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  27.48 
 
 		 627 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  26.82 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  27.95 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00539  hypothetical protein  19.09 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  24.51 
 
 		 533 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 600 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 600 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  22.37 
 
 		 619 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  22.37 
 
 		 531 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 236 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03073  hypothetical protein  20.94 
 
 		 402 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.67 
 
 		 650 aa  47.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 568 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  23.2 
 
 		 680 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  23.2 
 
 		 680 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.82 
 
 		 650 aa  45.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.84 
 
 		 617 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  32.18 
 
 		 606 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  33.33 
 
 		 616 aa  44.3  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>