35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3931 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  62.99 
 
 		 724 aa  895    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  100 
 
 		 741 aa  1490    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  62.99 
 
 		 724 aa  895    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  59.69 
 
 		 717 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  62.99 
 
 		 724 aa  895    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  44.84 
 
 		 714 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  44.87 
 
 		 713 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  45.54 
 
 		 721 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  33.77 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  31.16 
 
 		 693 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  26.75 
 
 		 714 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  28.57 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 707 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 709 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  26.54 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  26.72 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  26.72 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  26.72 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  23.88 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  23.58 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  27.51 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  48.61 
 
 		 104 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  48.61 
 
 		 104 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.642999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  22.46 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6008  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5426  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.705268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  26.01 
 
 		 707 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.85 
 
 		 650 aa  48.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.59 
 
 		 617 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  24.34 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.99 
 
 		 650 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>