27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2616 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  72.02 
 
 
709 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  100 
 
 
572 aa  1158    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  54.69 
 
 
707 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  32.18 
 
 
714 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  29.36 
 
 
693 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  26.81 
 
 
713 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  28.05 
 
 
724 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  28.05 
 
 
724 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  28.05 
 
 
724 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  28.13 
 
 
714 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  29.06 
 
 
717 aa  97.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  26.69 
 
 
721 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  26.54 
 
 
741 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  28.32 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  26.26 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  26.26 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  26.26 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  26.26 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  26.26 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  26.26 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  30.52 
 
 
731 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  30.52 
 
 
731 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  23.97 
 
 
475 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6008  hypothetical protein  31.63 
 
 
100 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5426  hypothetical protein  31.63 
 
 
100 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.705268 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.642999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>