31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4986 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  100 
 
 
724 aa  1477    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  100 
 
 
724 aa  1477    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  58.38 
 
 
717 aa  798    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  62.99 
 
 
741 aa  895    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  100 
 
 
724 aa  1477    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  46.62 
 
 
721 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  46.46 
 
 
713 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  43.93 
 
 
714 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  31.64 
 
 
693 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  32.53 
 
 
645 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  25.67 
 
 
714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  26.91 
 
 
707 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  26.38 
 
 
731 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  26.38 
 
 
731 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  27.05 
 
 
709 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  28.05 
 
 
572 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25 
 
 
688 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  22.88 
 
 
616 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6008  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5426  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.705268 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  46.48 
 
 
104 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  46.48 
 
 
104 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.642999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  22.82 
 
 
606 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.44 
 
 
650 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  23.88 
 
 
568 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>